實驗室凈化工程是將實驗室某一區域開辟出來，專門用于建造有空氣潔凈等級的、實驗環境要求相對較高的實驗室或者無菌室。實驗室凈化工程系統與傳統的專業車間空氣凈化施工潔凈室系統其實是大同小異的，只不過實驗室對潔凈室內的壓力、微生物控制及溫濕度控制相對較工業潔凈室要嚴格。常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾心彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等，專業車間空氣凈化潔凈實驗室必須按照《潔凈室施工與驗收標準》采用可以較好的密封并且不產塵的材料進行隔斷、吊頂裝修，潔凈實驗室通風系統一般采用組合式空調機組，其送風系統與各業潔凈室工程不同的地方是，不是所有實驗室都可以設置回風系統的，這需要根據用戶實驗室的用途以及實驗產品而定。

以集成電路為代表的工業環境控制中多采用工業潔凈技術和工業潔凈室；而在醫學中，多采用生物專業車間空氣凈化潔凈室進行微生物污染控制。在生物潔凈室里，這些微生物多由細菌和真菌組成，粒徑尺寸在0.2um以上，常見的細菌粒徑都在0.5um以上，并且多數依附在其他物質微粒上。生物污染渠道不僅通過空氣，還與人體、與操作人員的服裝有關。廣州專業車間空氣凈化在醫學研究領域中，生物實驗室、無菌實驗室以及供生物化學、醫學實驗用的“特殊飼養動物”飼養室也都十分需要控制微生物污染。

廣州車間空氣凈化現代化妝品中大多含有蛋白質、維生素、氨基酸、植物萃取液等，這些組分為細菌、霉菌等微生物的滋生、繁殖提供了有利條件。因此，微生物的污染是影響化妝品質量的重要因素。化妝品生產過程中使用的潔凈室的控制對象主要是塵粒、微生物，與藥品生產用的潔凈室要求類似。目前，化妝品生產用潔凈室的空氣潔凈度等級可參照藥品的GMP規范進行。專業車間空氣凈化在食品工廠的生產過程中，設施的嚴格管理是確保食品的安全衛生，防止發生由于病原大腸菌、沙門氏菌造成的食品中毒或飲料中混入霉菌等的重要手段。20世紀90年代至今，WHO及一些發達國家引入HACCP（危害分析關鍵控制點）系統，制定了利用衛生管理生產過程的食品生產承認制度。

廣州車間空氣凈化無塵車間的圍護結構和室內裝修材料宜選用氣密性良好，同時在溫度、濕度等變化時，本身變形小的材料；墻壁和頂棚表面應光潔平整、不起灰、不落塵、耐腐蝕、耐沖擊、易清洗。為了使無塵車間的建筑表面盡量少積灰、易清掃，應在建筑構造上避免或減少凹凸面，墻面與地面、墻面與頂棚、墻面與墻面的相接處也不宜做成一般的直角，宜做成半徑大于或等于50mm的圓角。專業車間空氣凈化壁面涂層的色彩要和諧、雅致、素淡，以便于顯現壁面上的污染物。同樣，地面也應做到平整、無縫隙、耐磨、耐腐蝕、耐沖擊、不積聚靜電、易除塵清洗。